Биологи ЧелГУ облегчили ведение микробиологического мониторинга в челябинской горбольнице №6

​Выпускники направленности «Микробиология» биологического факультета Челябинского государственного университета Виктория Бирюкова и Василий Мошкин в качестве дипломной работы разработали алгоритм создания дашбордов для реанимационно-хирургического, реанимационно-терапевтического отделений и ожоговой реанимации Городской клинической больницы №6 города Челябинска. Врачи уже применяют разработки студентов.​​​

​Запрос на то, чтобы облегчить ведение микробиологического мониторинга, то есть комплексного и динамического наблюдения за патогенными и условно-патогенными микроорганизмами, поступил нашим биологам от заведующей лабораторией клинической микробиологии Городской клинической больницы №6 города Челябинска Екатерины Егоровой. Врачам был необходим алгоритм создания дашбордов — интерактивных панелей, состоящих из множества графиков. При этом важно было отсеять персональные данные пациентов, которые нельзя разглашать, и проанализировать сведения для дальнейшей работы с данными о приоритетных бактериальных патогенах. Научным руководителем сту​​дентов выступила доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии Светлана Андреева.

«От пациентов отделений интенсивной терапии всё чаще стали выделять полирезистентные штаммы бактерий, то есть те, которые устойчивы к большинству антибиотиков, что отражает общемировую тенденцию — поясняет Светлана Андреева. — Врачам важно знать спектр чувствительности бактерий, т​ак как первичную антибиотикотерапию начинают ещё до получения результатов анализов: нужно корректировать схему лечения пациента и не назначать антибиотики, которые окажутся неэффективными. Более того, при появлении таких микроорганизмов нужно искать новые антибактериальные препараты и вводить более жёсткие противоэпидемические мероприятия в отношении инфекций, вызванных полирезистентными бактериями, а эти решения принимаются уже на всероссийском уровне. Поэтому микробиологи должны передавать информацию о появлении устойчивых к антибиотикам бактерий как на локальном уровне, так и на общероссийском и мировом — во Всемирную организацию здравоохранения. Для этого нужно было перенести данные из лабораторной информационной системы «Микроб-2» на платформу AMRcloud, создать дашборды и QR-коды для облегчения доступа к этой информацииврачей-клиницистов, клинических фармакологов и эпидемиологов. Наши студенты разработали универсальную инструкцию, как это сделать».

Виктория Бирюкова создавала дашборды для реанимационно-терапевтического и реанимационно-хирургического отделений, Василий Мошкин работал с отделением ожоговой реанимации.

«В наши задачи входило: согласование состава информации и графиков в дашборде с работниками лаборатори​​и ГКБ №6; поиск и сбор необходимых данных с помощью программы «Микроб-2»; добавление на онлайн-платформу AMRcloud полученного набора данных и егоредактирование; создание графиков и дашбордов на платформе; добавление графиков в дашборды. И ещё написание алгоритма создания дашбордов на основе всех проделанных нами этапов работы», — говорит Виктория Бирюкова.

В результате студенты разработали алгоритм создания дашборда с набором данных о клиническом материале, видовом спектре микроорганизмов и чувствитель​​​ности бактерий к антибиотикам. В данный момент алгоритмы уже внедрены в работу больницы.

«Алгоритм создания дашборда необходим работникам лабораторий и больниц для того, чтобы они могли сами создавать дашборды под свои нужды, следуя инструкции из данного алгоритма, — комментиру​​ет Василий Мошкин. — С помощью дашборда они смогут наглядно видеть всю картину: какие именно микроорганизмы были обнаружены в каждом конкретном клиническом материале, как и за какое время изменился видовой состав этих микроорганизмов, какие антибиотики и в какой момент стали действовать лучше или хуже против данных микроорганизмов».​​​